Hlavným rozdielom medzi vertikálnymi frézkami a horizontálnymi frézkami je vertikálne usporiadanie vretena. Okrem rôznych usporiadaní vretien možno pracovný stôl zdvíhať a spúšťať. Frézy používané vo vertikálnych frézkach sú pomerne flexibilné a majú širšiu škálu aplikácií. Možno použiť stopkové frézy, strojové skľučovadlá, vrtáky atď. Môžu frézovať drážky pre pero, frézovacie roviny, vyvrtávacie otvory atď. Horizontálne frézky môžu používať aj rôzne rezné nástroje uvedené vyššie, ale nie sú také pohodlné ako vertikálne frézky. Hlavnou výhodou je, že závesné rámy môžu byť použité na zvýšenie pevnosti rezných nástrojov (hlavne trojstranné frézy, frézy na plechy atď.). Môžu frézovať drážky, roviny frézovania, rezať atď. Horizontálne frézky sa vo všeobecnosti dodávajú s vertikálnou frézovacou hlavou, ktorá, hoci nie je taká výkonná a pevná ako vertikálne frézky, je dostatočná na to, aby zvládla operácie vertikálneho frézovania. Vďaka tomu je celková funkčnosť horizontálnych frézok výkonnejšia ako vertikálnych frézok. Vertikálne frézky túto vlastnosť nemajú a nedokážu spracovať obrobky vhodné na horizontálne frézovanie. Produktivita je vyššia ako pri horizontálnych frézkach.
Vertikálna frézka je vhodná na opracovanie rôznych dielov ako sú rovné plochy, naklonené plochy, drážky, otvory a pod. Ide o ideálne obrábacie zariadenie pre priemyselné odvetvia ako je strojárstvo, formy, prístroje, merače, automobily, motocykle atď.
Ušetrite investície do vybavenia. Avšak kvôli vysokému počtu zvláštnych úloh pri vertikálnom frézovaní táto horizontálna frézka s vertikálnou frézovacou hlavou skutočne každý deň zavesí vertikálnu frézovaciu hlavu. Pri zvislom frézovaní nie je tak vhodný ako vertikálna frézka. Horizontálne frézovanie sa bežne používa na obrábanie ozubených kolies, drážok, drážkovanie, rezanie atď. Vertikálne frézky sa nepoužívajú len na ploché obrábanie, ale aj na obrobky s vysokými, nízkymi, zakrivenými a rovnými geometrickými tvarmi, ako sú formy. Vertikálne frézovanie môže výrazne preukázať svoje zručnosti.